法雨禅寺亦称后寺，位于白华顶左、光熙峰下。明万历八年（1580）大智禅师创海潮庵于千步沙之北，二十二年改名海潮寺。二十七年钦赐藏经。三十二年赐帑金，住持如寿、如光等增建殿宇，三十四年，赐额“护国永寿镇海禅寺”。明参将陈九思《今上赐“护国镇海禅寺”奉题一首》诗云:“东表神州浸大赢，盘根无地巨鳌擎。琳宫又创天开境，宝号新颁帝赐名。佛火夜悬龙藏晓，海灵朝结蜃楼明。香船万里帆于叶，得渡争跨彼岸行。”三十九年，再赐《藏经》。四十年闰十一月遭火，寺尽焚。四十二年，住持了空等重建斋堂、止阁，余殿逐年建复。崇祯十六年（1643），圆通殿焚毁。

清顺治三年（1646），住持明如于圆通殿址建小殿5间、伽蓝殿5间。康熙八年（1669）遭寇乱，寺焚，唯存殿塔顶。十年，水师提督张杰捐建大殿5间，当年遣僧，沦为荒墟。二十三年弛海禁，住持明益治荒结宇。二十六年，提督陈世凯等延请别庵性统禅师为住持，建藏经阁、东禅堂、三生堂等，翌年，建智食楼、教诫楼。二十八年赐帑重建方丈殿，次年建圆通宝殿。三十二年，建大雄宝殿及蓝公生祠。此后，又有禅堂、水月楼、怡情室、天王殿等殿堂之建。三十八年，赐金陵（今南京市）明故宫建材及琉璃瓦重建圆通宝殿，因殿顶有皇家宫殿九龙藻井，又称九龙殿，赐额“法雨禅寺”。雍正九年（1731），赐帑建御碑亭、天后阁、牌坊等。光绪初年，住持立山翻建圆通宝殿及大雄宝殿。光绪十二年（1886），住持化闻建拜经楼，渐成巨刹。

新中国成立初，殿宇年久失修，1956年，住持妙善鼎新之。后由海军进驻。1980年，海军腾退，1983年起，由普陀山佛协全面修复，重塑佛像，大修九龙宝殿。同年，国务院60号文件列法雨寺为全国汉族地区142座重点开放寺院之一。尔后，新建或重建的有拜经楼、九龙壁、石经幢、石牌坊等。1985年中央办公厅、国务院办公厅正式将法雨寺划归普陀山佛教协会管理使用。1990年浙江省人民政府列法雨寺为省级重点文物保护单位。

法雨寺基宽200米，深235米。东边天后阁3间，阁下为山门，建于清雍正九年（1731）。院内古木成荫，昔有石牌坊1座、旗杆2座和镌有“唵嘛呢叭咪吽”照壁1座，均已毁。现新建九龙壁高2米，宽12.5米，浮雕盘龙9条。东、西石经幢各1座，高12米，称“尊胜幢”和“大悲幢”。

中间第一重天王殿建于康熙三十七年（1698）。入门，东钟楼、西鼓楼，均双层重檐。拾级而上，第二重玉佛殿建于康熙二十六年（1687），雍正年间改名御碑殿，内竖汉白玉雍正御碑，并供玉佛，均已毁。现供玉佛高1.6米，1989年从北京永乐宫请来。

第三重圆通宝殿，单层重檐歇山顶，盖黄琉璃瓦，内顶九龙盘拱藻井，系从明故宫拆建；光绪五年住持立山大修，殿中供奉高6.6米毗卢观音座像，两旁善财、龙女；后壁为大型彩塑海岛观音群像，两边十八罗汉；殿外石栏“二十四孝图”乃明代石刻精品。庭院中有古银杏树2株。1962年郭沫若题名为“龙凤古柏”。

第四重御碑殿，昔有“康熙蠲免钱粮碑”及雍正汉白玉御碑，均已毁。现殿中供奉千手观音。第五重大雄宝殿，中供释迦牟尼佛、阿弥陀佛、消灾延寿药师佛，合称“三世佛”。大殿东配殿供“西方三圣”；西配殿供关帝。第六重藏经阁，楼上昔为印光法师寮房，现为“印光法师纪念堂”。楼下中间法堂，西侧称正续堂，又称“西方丈”或光熙山房；东侧称“东方丈”或锦屏丈室，均建于康熙二十六年，光绪三年住持立山重建。

东山门内依次为龙王堂、三圣堂，今为伽蓝殿；松风阁，又称芋香楼，楼下为功德堂；内坛，上悬康熙三十八年御书“修持净业”匾。东侧第二排依次为后斋堂，后改建为拜经楼，毁后于1989年重建；鹤烟居、香积厨，今改建为大斋堂。

西山门内依次为蓝公祠，内祠挂清定海总兵蓝理像；水月楼，楼下称华悦堂，现称老客堂；挹翠轩，楼下称三生堂，今作库房；正续堂，又称大方丈（殿），现楼下作新法堂。西侧第二排依次为华楼，1984年建为1号宾客楼；斋戒厅，旧为留衣堂，今重建为2号宾客楼；雨华楼，今称新客堂；智食楼，又称云水堂，今作餐厅；怡情室，又称珠宝殿，内供康熙四十八年御赐珠宝观音1尊，建国初失窃。

1989年以来，改建西客堂、翻修大雄宝殿。挂有赵朴初、张性初、孙信德、马鼎煌等所书楹联27副，匾额35块。殿台六重，依山起势，飞楼插空，曲径通幽，蔚为壮观。2006年5月公布为全国文物保护单位。